Stages divisie Hart en Longen
Stages divisie Hart en Longen
Bekijk het stage-aanbod van de divisie Hart & Longen (DH&L). Je kunt meer informatie vinden over de onderwijs door en stageplaatsen bij onze afdelingen op de website van het Hart en vaatcentrum. Onze contactgegevens vind je onderaan deze pagina.
Psychosociale gezondheid van patiënten voor en na Longtransplantatieuitklapper, klik om te openen
Onderwerp
Een succesvolle longtransplantatie verlengt het leven van een patiënt met een eindstadium longziekte en draagt bij aan de kwaliteit van leven. Uit literatuur is bekend dat psychologische problemen zoals angst , depressie en andere distress een negatieve invloed kunnen hebben op de uitkomst. Verbetering van de psychologische zorg zou kunnen leiden tot verbetering van survival en kwaliteit van leven bij deze patiënten. Om deze reden is het van belang de psychosociale gezondheid van patiënten voor en na longtransplantatie te onderzoeken.
Doel
Doel van het onderzoek is het identificeren van de prevalentie van angst, depressie en psychologische distress bij patiënten voor en na longtransplantatie en samenhang met andere variabelen zoals therapietrouw van medicatie, somatische factoren en overleving.
Je werkt samen met een PhD student en zal zelfstandig in het AZN het onderzoek opzetten gelijkend aan de opzet in het UMCU.
Methode
Een longitudinale studie wordt verricht aan de hand van vragenlijsten. Deze worden in een database verwerkt met SPSS en statistisch geanalyseerd. Mogelijkheid tot het mee schrijven aan een artikel over de resultaten behoort tot de mogelijkheden.
Ook is het mogelijk om eens mee te lopen op de poli longtransplantatie.
Wanneer
Zes maanden stage vanaf september 2018
Het onderzoek
Een cross sectionele studie is reeds voltooid. We zijn bezig met een longitudinale studie en zoeken een enthousiaste student die ons longitudinale onderzoek naar mentale gezondheid binnen het longtransplantatieteam op locatie St Antonius ziekenhuis zou kunnen opzetten.
Combinatie onderzoek/klinisch
Het behoort tot de mogelijkheden een keertje mee te lopen op de polikliniek longtransplantatie. Ook maak je deel uit van het psychosociaal multidisciplinair team waarbij maandelijks bespreking is.
Contact
Renske Schappin, post doc en epidemioloog
Marion Wessels, verpleegkundig specialist longtransplantatie en PhD student.
Psychosociale gezondheid van partners/naasten van patiënten voor en na Longtransplantatieuitklapper, klik om te openen
Onderwerp
Een succesvolle longtransplantatie verlengt het leven van een patiënt met een eindstadium longziekte en draagt bij aan de kwaliteit van leven. Uit literatuur weten we dat niet alleen voor de patiënten een longtransplantatie een stressvolle periode is, maar ook partners/naasten van patiënten in het longtransplantatie traject ervaren psychologische problemen. Een gezond sociaal netwerk is belangrijk en geassocieerd met therapietrouw van medicatie, en het aantal heropnames na transplantatie. Om deze reden is het van belang om te onderzoeken hoe de psychosociale gezondheid van partners/naasten van patiënten voor en na longtransplantatie is en wat de relatie is met andere variabelen. Dit is een belangrijk uitgangspunt voor het ontwikkelen van interventies
Doel
- Doel is prevalentie van psychologische problemen zoals angst, depressie en post traumatische stress.
- Relatie onderzoeken met andere variabelen zoals therapietrouw van medicatie, somatische factoren en overleving.
Methode
Een cross sectionele en longitudinale studie wordt verricht aan de hand van vragenlijsten. Deze worden in een database verwerkt met SPSS en statistisch geanalyseerd. Mogelijkheid tot het mee schrijven aan een artikel over de resultaten behoort tot de mogelijkheden.
Ook is het mogelijk om eens mee te lopen op de poli longtransplantatie.
Wanneer
Zes maanden stage vanaf september 2018
Het onderzoek
In deze studie zal de psychosociale gezondheid van partners/naasten van logtransplantatie patiënten worden onderzocht middels vragenlijsten en/of interviews. Je start met een literatuuronderzoek waarna we een cross sectioneel en longitudinaal onderzoek zullen opzetten in het UMCU.
Combinatie onderzoek/klinisch
Het behoort tot de mogelijkheden een keertje mee te lopen op de polikliniek longtransplantatie. Ook maak je deel uit van het psychosociaal multidisciplinair team waarbij maandelijks bespreking is.
Contact
Renske Schappin, post doc en epidemioloog
Marion Wessels, verpleegkundig specialist longtransplantatie en PhD student.
Postoperatieve myocardschade na niet cardiologische operatiesuitklapper, klik om te openen
Onderwerp
Postoperatieve myocardschade komt voor bij ongeveer 15-20% van de patiënten ouder dan 60 jaar die een grote, niet cardiologische operatie ondergaan. Deze postoperatieve myocardschade wordt gemeten met een troponine bepaling en is geassocieerd met een verhoogde mortaliteit. Echter, de onderliggende mechanismen zijn nog niet volledig bekend.
Doel
Het doel van deze studie is om de etiologie van postoperatieve myocardschade bij oudere patiënten die een grote, niet cardiologische operatie ondergaan te achterhalen. Daarnaast onderzoeken we de prognose van patiënten met postoperatieve myocardschade.
Methoden
Dit is een klinische studie waarbij we bij 360 postoperatieve patiënten (180 patiënten met myocardschade en 180 patiënten zonder) een CT-scan van het hart en de longen maken in de eerste dagen na hun operatie. Op die manier kunnen we zowel de relatie tussen postoperatieve myocardschade en longembolieën als de relatie tussen myocardschade en significant coronairlijden onderzoeken. De patiënten worden tot een jaar na de operatie gevolgd om eventuele (cardiovasculaire) events in het jaar na de operatie te detecteren.
Daarnaast is er een retrospectieve database beschikbaar van ongeveer 200 patiënten die een slokdarmresectie hebben ondergaan in de afgelopen 5 jaar. Deze database zal worden gebruikt voor een retrospectief onderzoek naar de relatie tussen postoperatieve myocardschade en een gecompliceerd beloop bij patiënten na een slokdarmresectie.
Wanneer
Beschikbaar vanaf september 2017, duur van stage 6-12 maanden.
Werkzaamheden student
De student zal zich o.a. bezig houden met de inclusies van patiënten. Hierbij informeert hij/zij de patiënten over de studie en vraagt hen om toestemming voor deelname aan de studie. De student verzamelt alle relevante patiënten informatie en vraagt de benodigde onderzoeken aan, waaronder een ECG en CT-scan van hart een longen. Daarbij zal de student regelmatig overleggen met verschillende specialisten, zoals de anesthesist die betrokken is bij de zorg voor patiënten met postoperatieve myocardschade, de radioloog die verantwoordelijk is voor beoordelen van de CT-scan, en de cardioloog en zaalarts die benaderd worden voor eventuele behandeling van gevonden afwijkingen op CT-scan. Daarnaast verricht de student klinische follow-up bij de geïncludeerde patiënten d.m.v. telefonisch contact 2 maanden en 1 jaar na de operatie.
Naast de werkzaamheden voor deze klinische studie zal de student een eigen deelproject krijgen. Het gaat hierbij om retrospectief cohort van ongeveer 200 patiënten die in de afgelopen 5 jaar een slokdarmresectie hebben ondergaan. De student zal dit cohort gebruiken om de relatie tussen postoperatieve myocardschade en een gecompliceerd beloop van patiënten na een slokdarmresectie te onderzoeken.
Contact
Laura Willemsen, arts-onderzoeker Julius Centrum.
CardioTargetIdentifieruitklapper, klik om te openen
Onderwerp
Het ontwikkelen van een cloud based tool voor de integratie en analyse van verschillende GWAS QTL datasets en het filteren op door de gebruiker bepaalde targets.
Doel
Het verbeteren en versnellen van de identificatie van significante QTL’s uit GWAS (genome wide associated studies) op basis van bepaalde targets voor vervolgonderzoek op het gebied van cardiologie.
Methoden
Software ontwikkeling:
- verzamelen van requirements, eisen en wensen
- analyse en Ontwerp
- realisatie
- testen
Technieken: Python, PHP, HTML, javascript
Wanneer
4 september tot 2 februari (week 36 t/m week 5)
Er is een inwerkperiode vanaf 14 augustus (week 33)
Het onderzoek
Datasets van verschillende genome studies bestaande uit expressie data (mQTL, eQTL, pQTL), belichten diverse aspecten van genexpressie. Op het gebied van hart- en vaatziekten is deze data van belang voor o.a. annotatie van sequencing data uit laboratorium onderzoek.
De analyse van deze datasets bestaat uit meerdere stappen en is tot nog toe een handmatig en tijdrovend proces. Daarom zullen deze stappen worden geautomatiseerd in een applicatie. Diverse datasets worden samen geïntegreerd, daartoe worden deze omgezet naar een uniform format.
Vervolgens worden deze datasets worden gefilterd op significant tot expressie komende QTL’s. Als laatste stap zullen deze QTL’s worden gerangschikt voor (door de gebruiker) bepaalde targets, bijv. SNP’s en antilichamen. Dit garandeert de bruikbaarheid van deze loci voor vervolgonderzoek in het lab.
De applicatie zal remote benaderbaar zijn als gebruikersvriendelijke webapplicatie.
Contact
Dr. Sander van der Laan
Loss-of-function variants on plaque characteristicsuitklapper, klik om te openen
Topic
Assess the impact of loss-of-function variants on atherosclerotic plaque characteristics and secondary clinical outcome.
Introduction
Recently the Human Exome Aggregation Consortium (ExAc) inventoried and identified the existence of loss-of-function (LoF) variants in the human genome1. ExAC discovered that each individual on average carries ~20 genes that are completely knocked-out, and heterozygous for up to ~60 genes1. They also noted that some genes are completely devoid of LoF variants, suggesting that such genes are evolutionarily and developmentally crucial to sustain life. This bares relevance to the discovery and interpretation disease susceptibility loci. This project aims to investigate to what extent LoF variants impact atherosclerotic plaque composition, aneurysmal wall characteristics, and (monocyte) gene expression, and thereby disease risk.
Objective
This project aims to investigate to what extent LoF variants impact atherosclerotic plaque composition, aneurysmal wall characteristics, and (monocyte) gene expression, and thereby disease risk.
Duration
6-9 months
Requirements
Experience and/or knowledge of UNIX and/or macOS based operating systems, UNIX-based job-submission systems, and with R, Perl and/or Python is strongly advised.
Methods
We developed an in-house pipeline to assess the presence of LoF variants in a GWAS dataset. We will apply this pipeline on data from the At2600hero-Express Biobank Study (AE) which comprises n~3,500 patients undergoing carotid or femoral endarterectomy (CEA or FEA, respectively)2. In addition, we will apply this pipeline on data from the Abdominal Aortic Aneurysm Express Biobank Study (AAA, n = 776), and CTMM Circulating Cells (CTMM, n = 700). We genotyped a subset of n ~ 2,658 patients using commercially available genotyping platforms3. Whole-genome expression data is available from monocytes from CTMM. We also scanned ~35,000 histological slides of atherosclerotic and aneurysmal tissues at a high-resolution from the AE and the AAA. We will apply another in-house developed pipeline (slideToolkit, https://github.com/swvanderlaan/slideToolkit) to these high-resolution images to analyse histological markers4,5. For the purpose of this project we will associate LoF variants as determined by our pipeline to computer-analysed histological characteristics from the AE and AAA, and gene expression in CTMM. Follow-up in silico analyses include eQTL, mQTL, and network analyses on in-house and public datasets of significantly associated LoF target genes. Furthermore the association to secondary clinical outcome will be investigated.
Contact
Dr. Sander van der Laan
Wie ben je?uitklapper, klik om te openen
Vind je dat je anatomische kennis wel wat verdieping kan gebruiken? Heb je bijvoorbeeld chirurgische ambities of vind je dat iedere arts een goede anatomische basis moet hebben en wil je daarnaast ervaring opdoen in het verrichten van literatuuronderzoek? Dan is dit de keuzestage voor jou!
Contactuitklapper, klik om te openen
Ben jij geïnteresseerd in een keuzeonderwijs Borst-Buik-Bekken? Mail dan naar:
Drs. Matty Spinder, arts-anatoom
Wat ga je doen?uitklapper, klik om te openen
In een periode van 6 weken krijg je een unieke kans om samen met collegastudenten in kleine groepen (2-4 studenten) het volledige borst-buik-bekkengebied in een stoffelijk overschot te dissecteren. Het is een intensieve cursus, waarbij er veel interactie mogelijk is tussen studenten en begeleiding, waardoor er doorgaans een zeer stijle leercurve is.
De belangrijkste leerdoelen zijn: zelfstandig de dissectie voorbereiden en uitvoeren, het samenwerken met je collega’s en het bewaken van je eigen leerproces. Naast het dissecteren zul je zelfstandig een verdiepend literatuuronderzoek doen binnen een anatomisch en/of embryologisch onderwerp van jouw keuze.
QUALITY-studieuitklapper, klik om te openen
QUantiferon-plus in Actieve en Latente Infectie met Tuberculeuze mYcobacteriën
Tuberculose komt ook in Nederland nog regelmatig voor. Het onderscheid tussen actieve tuberculose en een latente infectie is vaak moeilijk, maar heeft grote klinische consequenties. Er bestaan geen biomarkers die dat onderscheid kunnen maken.
Specialismen
- Longziekten en Tuberculose
- Laboratorium Translationele Immunologie
Doel van de stage
- Onderzoeken of Quantiferon-Plus (2015) kan differentiëren tussen latente en actieve tuberculose infectie
- Het identificeren van potentiële cytokines die kunnen differentiëren tussen actieve en latente tuberculose infectie
Wanneer
Gedurende 6 maanden in 2016.
Wij bieden
Een afwisselende, leerzame wetenschapsstage in een inspirerende omgeving. Je stage wordt ingevuld door laboratoriumexperimenten, bloedafnames bij patiënten thuis en een literatuurstudie.
Wie zoeken we
Ben je een enthousiaste SUMMA of geneeskunde student? Heb je speciale interesse in infectieziekten/longziekten en immunologie? Neem contact met ons op!
Contact
Stefan Nierkens, Head Utrecht Center for Diagnostic Advances in Immunology Research
Regina Hofland, AIOS longziekten, PhD student
Contact met de afdelingen van de DH&Luitklapper, klik om te openen
Afdeling Medische Fysiologie
Stagecoördinator: dr. Marcel van der Heyden
m.a.g.vanderheyden@umcutrecht.nl
Afdeling Experimentele Cardiologie
Stagecoördinator: dr. Pieter Vader
Afdeling Cardiologie
Secretariaat
onderwijs-cardio@umcutrecht.nl
Afdeling Longziekten
Secretariaat
secretariaatlongziekten@umcutrecht.nl
Afdeling Cardio-Thoracale Chirurgie
Secretariaat