Short Tandem Repeat analyses
Short Tandem Repeat analyses
Weefselidentificatie
Short Tandem Repeats (STRs) zijn repeterende stukjes DNA (bijv. CATGCATGCATG), die door het hele genoom op vaste posities voorkomen, op alle chromosomen. Iedere STR heeft daarnaast twee allelen, soms verschilt deze STR van lengte voor beide allelen (heterozygoot) of heeft deze voor beide allelen dezelfde lengte (homozygoot). De specifieke samenstelling van de STR lengtes per individu is zo kenmerkend dat individuen op grond hiervan onderscheiden kunnen worden. Door de STRs te amplificeren in een PCR reactie met fluorescent gelabelde primers, ontstaan er één of meerdere PCR producten, waarbij de lengte van het PCR product afhangt van de lengte van de STRs. Door de grootte van de PCR producten van 2 monsters te vergelijken is het mogelijk te bepalen of verschillende stukjes weefsel van hetzelfde, dan wel van een ander individu afkomstig zijn.
Chimerisme
Bij een chimerisme bepaling wordt gebruik gemaakt van STR analyse (zie uitleg weefselidentificatie) om zo na een allogene beenmerg- of stamceltransplantatie onderscheid te kunnen maken tussen cellen van de ontvanger en die van de donor. De bedoeling is dat na een beenmerg- of stamceltransplantatie de cellen van de ontvanger worden vervangen door de cellen van de donor. Met een chimerisme bepaling kan dit bij de ontvanger worden gemonitord met behulp van typering van de STR profielen vóór en ná de transplantatie.